土壤是蔬菜通过根部吸收重金属的主要介质，其重金属含量直接影响蔬菜对该元素的吸收和累积，所以土壤重金属污染是蔬菜重金属污染的重要原因。

4.1 工业化污水和生活用水灌溉

在中国部分地区，会有大量未经处理或处理未达标的工业污水、城市生活用水直接排放到菜地中，导致菜地土壤重金属超标。如西安污灌土中的重金属含量明显高于正常土，其重金属累积强度系数在1.11~10.59 之间。苏振旺等发现，河北邢台污灌区中心区域的菜地土壤Cd 平均含量已超过国家标准数倍。

4.2 化学农药以及有机肥料的滥用

磷肥中含有多种微量元素，其中一些为有害元素，Cd 是情况较为严重的一种。

何振立的研究结果表明，在人类活动对土壤Cd 的贡献中，磷肥占54%~58%。磷肥在生产过程中磷矿石内金属杂质难以挥发，任何生产工艺都不可能完全消除重金属，这样长期施用磷肥会使有毒重金属进入土壤，进而在植物体内富集。

张树清等发现，有机肥中也常含有一定量的重金属；刘荣乐等对中国8 省（市） 商品有机肥的调查结果显示，有机肥中各种重金属均出现了不同程度的超标。

4.3 采矿、冶炼、造纸和城市垃圾的施用

采矿、冶炼、造纸等活动产生的废弃物未经处理或不达标排放，均将最终进入土壤和水体，并造成土壤或水体重金属含量超标。

许炼烽等在天津市以施用城市垃圾肥料为主的菜田，检出土壤中的Cu、Pb、Cd、As 含量高于背景值的0.3~1.0倍，Hg 含量甚至高出30 多倍。

刘芳等研究大型炼锌厂周边土壤及蔬菜的汞污染情况时发现，炼锌厂周边土壤样品Hg的超标率为78%，其中污染最严重区域土壤中的汞含量是背景点土壤的29 倍，已达到重度污染；所有蔬菜样品的Hg 含量超过无公害蔬菜重金属限量指标，最大超标64.5 倍，说明炼锌厂Hg 排放对其周边土壤和蔬菜的Hg 污染均有显著影响。

4.4 畜禽粪便

随着现代畜牧业的发展，饲料添加剂应用越来越广泛，而其中往往含有一定量如Cu、Zn 等重金属。这些重金属随着畜禽粪便排出而污染环境，这些肥料中的重金属也会积累在土壤中，成为一种污染源。

柳开楼等研究发现，红壤性水稻土施用猪粪30 年后，Cu、Zn、Cr、As 含量显著增加。